汤普森1967年出版的《行动中的组织》（Organizations in Action）是组织理论史上最具原创性的著作之一，尽管篇幅简短却极为深刻。他在书中将开放系统视角与有限理性理论结合，系统分析组织如何在不确定性环境中寻求合理性。他提出的三种相互依存类型（集合型、顺次型、交互型）成为组织设计和供应链管理研究的基础分析工具。他对技术核心缓冲机制的分析，解释了现代大组织为何需要市场营销、采购、人力资源等边界跨越部门。他英年早逝（53岁），但这本薄薄的著作持续影响了此后数十年的组织理论研究。